博山区卫生局担负着全区医疗卫生、预防保健等工作的行政管理与业务指导职能。局机关设办公室、政工科、财务科、医政科、爱卫会办公室5个科室。区管医疗卫生机构共304个。其中区直医疗卫生单位7个，中心卫生院4个，镇卫生院8个，区管企业医院10个。城区设4 个社区卫生服务站，13个社区卫生服务所。医疗机构中设有病床1106个张，在职职工1420人。其中卫生技术人员1397人，高级职称76人，中级职称519人。年门诊535983人次，出院12206人次。
    近年来，该局认真贯彻“以农村为重点，预防为主，中西医并重，依靠科技与教育，动员全社会参与，为人民健康服务，为社会主义现代化建设服务”的新时期卫生工作方针，加大工作力度，深化改革，强化管理，使全区卫生工作呈现出持续、健康、快速发展的好势头。卫生改革取得实质性进展，进行了医疗卫生单位内部人事、分配制度改革，推行了“院长负责制、中层干部和卫生技术人员聘任制、绩效工资制”，激发了内部活力。推行了药品集中招标采购，遏制了药品购销活动中的不正之风。积极探索农村卫生组织一体化管理的新路子，全区12个镇全部推行了镇村卫生组织一体化管理，199个卫生室合并改建为173个，镇办镇管135个，镇办镇管率达77.7%。农村卫生“三项建设”进展顺利，镇卫生院改貌工程如期完成。区医院、山头镇卫生院门诊楼，北博山中心卫生院、池上中心卫生院病房楼，岳庄中心卫生院康复楼相继竣工。卫生支农受到广大群众欢迎，连续三年获得市卫生、科技、文化三下乡先进单位称号。健全了社区卫生服务网络，完善了社区卫生服务功能。截止2001年，已建成以区医院、区中医院、区妇幼保健院为龙头的4个社区卫生服务站、13个社区卫生服务所，覆盖21个居委会，覆盖率达88%，社区人口覆盖率达到了85%以上。区中医院达到二级甲等医院标准，区防疫站达到二级甲等防疫站标准，5处镇卫生院达到一级甲等卫生院标准。有13处医院达到“爱婴医院”标准，博山区被授予“爱婴区”称号。三级医疗预防保健网不断巩固发展，“四苗”接种率达到99%，巩固了第三个85%初保达标成果，有苗传染病得到有效控制。中医药事业稳步发展，区中医院与韩国韩城汉医院结为友好医院，区中医院骨伤科被市评为“中医建设特色专科”。医疗卫生单位内部人事分配制度改革、社区卫生服务、农村卫生组织一体化管理等工作走在了全市前列。先后荣获了“全国改水改厕先进区”、“全省红十字会系统先进集体”荣誉称号，区卫生局连被评为市卫生工作先进集体。
    当前和今后一段时间，博山区卫生局将认真实践江总书记“三个代表”重要思想，贯彻落实国务院办公厅转发的《关于农村卫生改革与发展的实施意见》，加大农村卫生改革与发展步伐，制定并实施今后10年初级卫生保健规划。实行农村卫生工作全行业管理，改革镇卫生院管理体制，加快镇卫生院基本建设和医疗设备更新步伐，强化对乡村医生的从业技能培训和执业行为监管，积极探索农民医疗保险的新路子，逐步推行农民大病统筹合作医疗保险。进一步深化人事、分配制度改革，实行全员聘用制、岗位工资制，按需设岗，竞争上岗，优化组合。完善和规范城市社区卫生服务，健全社区卫生服务管理体系，强化街道办事处对社区卫生服务的管理职能。强化卫生全行业管理，规范医疗市场。进行公立医院产权制度改革试点，探索公司制医院管理新路子，优化配置区域内卫生资源，适度发展营利性医疗机构，鼓励竞争，优胜劣汰。改革卫生事业经费补助办法，实行以按基本卫生服务项目等方式为主的定额和定项补助方式。在二级医院实行药品分开核算、分别管理，继续推行药品统一集中招标采购。加强医院经营管理，全面改进医院工作流程，增强综合服务能力。加强医疗质量监管，提高各级医院的技术水平和服务能力。坚持预防为主，切实做好预防保健工作。加强健康教育，向人民群众宣传、普及健康科学的生活方式。加快人才培养力度，增强科技创新能力。坚持中西医并重，大力发展中医药事业。推行卫生法制建设，提高依法行政水平。巩固发展国家卫生城市、“爱婴区”、“无偿献血先进区”创建成果。强化对全体共产党员的教育和管理，切实加强党的基层组织建设。加大对卫生管理干部的培训力度，为卫生改革与发展提供坚强的组织保证。全面落实中共中央下发的《公民道德建设实施纲要》，加强卫生行业的精神文明建设，努力开创全区卫生工作的新局面。